推行宗教改革过程中形成的，也是藏传佛教中形成最晚的一个教派。

宗喀巴生在西藏帕竹政权取代萨迦政权之时，上层僧人不仅直接参与政治、经济权力的角逐，而且生活日趋腐朽，在社会上逐渐失去民心。

针对这一情况，宗喀巴以重视戒律为号召，到处讲经说法，著书立说，抨击僧人不守戒律，积极推进西藏佛教改革。

1409年藏历正月，他在拉萨大昭寺发起祈愿大法会，这就是流传至今的传召大法会。

法会后，宗喀巴建起著名的甘丹寺，创建起严守戒律的格鲁派。

格鲁，藏语意为善律。

由于宗喀巴及其追随者戴黄色僧帽，故又俗称黄教。

黄教创建后，相继又建立起哲蚌寺、色拉寺、扎什伦布寺、塔尔寺、拉卜楞寺，它们与甘丹寺一起并称为格鲁派的六大寺院。

此外，黄教还创建了班禅两个最大的活佛转世系统。

宁玛派，红教，形成于公元11世纪，是藏传佛教中最早产生的一个教派。

由于该教派吸收和保留了大量本教色彩，重视寻找和挖掘古代朗达玛灭佛时佛教徒藏匿的经典，并认为自己弘扬的佛教，是公元8世纪吐蕃时代传下来的，因而古旧，所以称宁玛。

宁玛，藏语意为古、旧的意思。

加上该教派僧人只戴红色僧帽，因而又称红教。

红教以密宗修习为主，其思想受汉语系佛教影响，与内地掸宗“明心见性”说法相似。

林丹汗笃信藏传佛教，一生热衷于佛教事业，不仅推动了藏传佛教在左翼三万户地区的传播，而且为蒙古文化作出了一定的贡献。

1604年，刚即位的林丹汗就从四世达赖派驻蒙古地方掌管教法的迈达理呼图克图和卓尼绰尔济等黄教喇嘛接受了格鲁派，黄教的法戒。

1617年，西藏萨迦派僧侣沙尔呼图克图到达蒙古地区，寻找自己的支持者，林丹汗为沙尔呼图克图的法术所折服，并封他为国师，并接受深奥密乘之灌顶，于是林丹汗由黄教改信红教。

狭义上的红教仅指宁玛派，广义上包含了萨迦派和噶举派。

沙尔呼图克图为了取得林丹汗的信任，从五台山取来元世祖时萨迦派八思巴喇嘛用千金所铸的玛哈噶喇金佛，又称大黑天，为蒙元的护国神。

林丹汗在察汉浩特修建金顶白庙，将金佛供于其中。林丹汗试图效仿忽必烈与八思巴故事，利用他与沙尔呼图克图之间的关

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